MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus 386B plasmid Apa386Bp4

Total Repeats: 168

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021977	GAAA	2	8	973	980	75 %	0 %	25 %	0 %	529218761
2	NC_021977	GTT	2	6	1020	1025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218761
3	NC_021977	GTT	2	6	1077	1082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218761
4	NC_021977	AG	3	6	1117	1122	50 %	0 %	50 %	0 %	529218761
5	NC_021977	CGA	2	6	1123	1128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218761
6	NC_021977	ATCAC	2	10	1147	1156	40 %	20 %	0 %	40 %	529218761
7	NC_021977	GGC	2	6	1160	1165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218761
8	NC_021977	ATT	2	6	1227	1232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529218761
9	NC_021977	GGGC	2	8	1300	1307	0 %	0 %	75 %	25 %	529218761
10	NC_021977	CG	3	6	1338	1343	0 %	0 %	50 %	50 %	529218761
11	NC_021977	ACA	2	6	1444	1449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529218761
12	NC_021977	TCA	2	6	1502	1507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218761
13	NC_021977	ATG	2	6	1519	1524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218761
14	NC_021977	TTC	2	6	1533	1538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218761
15	NC_021977	AGA	2	6	1583	1588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218761
16	NC_021977	TGCG	2	8	1610	1617	0 %	25 %	50 %	25 %	529218761
17	NC_021977	GAA	2	6	1635	1640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218761
18	NC_021977	CCCA	2	8	1771	1778	25 %	0 %	0 %	75 %	529218761
19	NC_021977	ACG	2	6	1785	1790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218761
20	NC_021977	TCT	2	6	1843	1848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218761
21	NC_021977	ATC	2	6	1876	1881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218761
22	NC_021977	AGAA	2	8	1887	1894	75 %	0 %	25 %	0 %	529218761
23	NC_021977	TC	3	6	2012	2017	0 %	50 %	0 %	50 %	529218761
24	NC_021977	TTG	2	6	2134	2139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218761
25	NC_021977	TTG	2	6	2146	2151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218761
26	NC_021977	TTG	2	6	2168	2173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218761
27	NC_021977	CCA	2	6	2212	2217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529218761
28	NC_021977	AGA	2	6	2232	2237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218761
29	NC_021977	TCTG	2	8	2296	2303	0 %	50 %	25 %	25 %	529218761
30	NC_021977	GAT	2	6	2332	2337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218761
31	NC_021977	AATTA	2	10	2346	2355	60 %	40 %	0 %	0 %	529218761
32	NC_021977	GTG	2	6	2568	2573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218762
33	NC_021977	TTC	2	6	2585	2590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218762
34	NC_021977	TTG	2	6	2971	2976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218763
35	NC_021977	GTTT	2	8	3139	3146	0 %	75 %	25 %	0 %	529218763
36	NC_021977	CT	3	6	3240	3245	0 %	50 %	0 %	50 %	529218763
37	NC_021977	GGC	2	6	3249	3254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218763
38	NC_021977	CTC	2	6	3330	3335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529218763
39	NC_021977	TGTC	2	8	3376	3383	0 %	50 %	25 %	25 %	529218763
40	NC_021977	CAGA	2	8	3410	3417	50 %	0 %	25 %	25 %	529218763
41	NC_021977	AAG	2	6	3427	3432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218763
42	NC_021977	GAT	2	6	3725	3730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218764
43	NC_021977	CGT	2	6	3743	3748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218764
44	NC_021977	GA	3	6	3772	3777	50 %	0 %	50 %	0 %	529218764
45	NC_021977	GA	3	6	3937	3942	50 %	0 %	50 %	0 %	529218764
46	NC_021977	TGC	2	6	3974	3979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218764
47	NC_021977	TG	3	6	3994	3999	0 %	50 %	50 %	0 %	529218764
48	NC_021977	CGGA	2	8	4038	4045	25 %	0 %	50 %	25 %	529218764
49	NC_021977	TGC	2	6	4100	4105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218764
50	NC_021977	AGT	2	6	4120	4125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218764
51	NC_021977	CCA	2	6	4163	4168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529218764
52	NC_021977	TC	3	6	4219	4224	0 %	50 %	0 %	50 %	529218764
53	NC_021977	GAG	2	6	4237	4242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529218764
54	NC_021977	GCG	2	6	4317	4322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218764
55	NC_021977	GCG	2	6	4399	4404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218764
56	NC_021977	GCCT	2	8	4434	4441	0 %	25 %	25 %	50 %	529218764
57	NC_021977	AG	3	6	4447	4452	50 %	0 %	50 %	0 %	529218764
58	NC_021977	AGG	2	6	4460	4465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529218764
59	NC_021977	GGC	2	6	4548	4553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218764
60	NC_021977	AG	3	6	4614	4619	50 %	0 %	50 %	0 %	529218764
61	NC_021977	TGG	2	6	4652	4657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218764
62	NC_021977	TC	3	6	4660	4665	0 %	50 %	0 %	50 %	529218764
63	NC_021977	GGTCG	2	10	5063	5072	0 %	20 %	60 %	20 %	529218765
64	NC_021977	CGA	2	6	5091	5096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218765
65	NC_021977	CAG	2	6	5114	5119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218765
66	NC_021977	GCC	2	6	5184	5189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218765
67	NC_021977	CAGA	2	8	5204	5211	50 %	0 %	25 %	25 %	529218765
68	NC_021977	CGG	2	6	5283	5288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218765
69	NC_021977	TGCGG	2	10	5326	5335	0 %	20 %	60 %	20 %	529218765
70	NC_021977	TGG	2	6	5343	5348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218765
71	NC_021977	GC	3	6	5571	5576	0 %	0 %	50 %	50 %	529218766
72	NC_021977	GTT	2	6	5633	5638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218766
73	NC_021977	GAT	2	6	5665	5670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218766
74	NC_021977	GCGT	2	8	5677	5684	0 %	25 %	50 %	25 %	529218766
75	NC_021977	GA	3	6	5729	5734	50 %	0 %	50 %	0 %	529218766
76	NC_021977	GCG	2	6	5735	5740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218766
77	NC_021977	CGA	2	6	5746	5751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218766
78	NC_021977	ATCAC	2	10	5760	5769	40 %	20 %	0 %	40 %	529218766
79	NC_021977	GTT	2	6	5840	5845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218766
80	NC_021977	GCCG	2	8	5853	5860	0 %	0 %	50 %	50 %	529218766
81	NC_021977	GTT	2	6	5894	5899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218766
82	NC_021977	TTCG	2	8	5900	5907	0 %	50 %	25 %	25 %	529218766
83	NC_021977	GGGC	2	8	5913	5920	0 %	0 %	75 %	25 %	529218766
84	NC_021977	CG	3	6	5951	5956	0 %	0 %	50 %	50 %	529218766
85	NC_021977	CAT	2	6	6019	6024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218766
86	NC_021977	GTA	2	6	6164	6169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218766
87	NC_021977	GAA	2	6	6194	6199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218766
88	NC_021977	GAA	2	6	6248	6253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218766
89	NC_021977	CCG	2	6	6265	6270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218766
90	NC_021977	TCCG	2	8	6296	6303	0 %	25 %	25 %	50 %	529218766
91	NC_021977	TCG	2	6	6342	6347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218766
92	NC_021977	ACG	2	6	6398	6403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218766
93	NC_021977	TCA	2	6	6438	6443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218766
94	NC_021977	GCAG	2	8	6509	6516	25 %	0 %	50 %	25 %	529218766
95	NC_021977	AGA	2	6	6551	6556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218766
96	NC_021977	CTT	2	6	6565	6570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218766
97	NC_021977	TAAAT	2	10	6581	6590	60 %	40 %	0 %	0 %	529218766
98	NC_021977	TA	3	6	6602	6607	50 %	50 %	0 %	0 %	529218766
99	NC_021977	A	6	6	6696	6701	100 %	0 %	0 %	0 %	529218766
100	NC_021977	ATC	2	6	6737	6742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218766
101	NC_021977	TA	3	6	6755	6760	50 %	50 %	0 %	0 %	529218766
102	NC_021977	AT	3	6	6778	6783	50 %	50 %	0 %	0 %	529218766
103	NC_021977	ATA	2	6	6834	6839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529218766
104	NC_021977	TCA	2	6	6885	6890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218766
105	NC_021977	GAT	2	6	6893	6898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218766
106	NC_021977	TTC	2	6	7255	7260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218767
107	NC_021977	GAT	2	6	7288	7293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218767
108	NC_021977	GCTT	2	8	7324	7331	0 %	50 %	25 %	25 %	529218767
109	NC_021977	AGC	2	6	7375	7380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218767
110	NC_021977	CCT	2	6	7432	7437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529218767
111	NC_021977	TGC	2	6	7543	7548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218767
112	NC_021977	GCA	2	6	7561	7566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218767
113	NC_021977	TTC	2	6	7602	7607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218767
114	NC_021977	AAAT	2	8	7644	7651	75 %	25 %	0 %	0 %	529218767
115	NC_021977	TCCA	2	8	7656	7663	25 %	25 %	0 %	50 %	529218767
116	NC_021977	AGG	2	6	7725	7730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529218767
117	NC_021977	TGC	2	6	8242	8247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218768
118	NC_021977	GTTT	2	8	8374	8381	0 %	75 %	25 %	0 %	529218768
119	NC_021977	CT	3	6	8475	8480	0 %	50 %	0 %	50 %	529218768
120	NC_021977	GGC	2	6	8484	8489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218768
121	NC_021977	CTC	2	6	8565	8570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529218768
122	NC_021977	TGTC	2	8	8611	8618	0 %	50 %	25 %	25 %	529218768
123	NC_021977	CAGA	2	8	8645	8652	50 %	0 %	25 %	25 %	529218768
124	NC_021977	AAG	2	6	8662	8667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218768
125	NC_021977	TTGAT	2	10	8819	8828	20 %	60 %	20 %	0 %	529218768
126	NC_021977	GAG	2	6	8854	8859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529218768
127	NC_021977	GACG	2	8	8887	8894	25 %	0 %	50 %	25 %	529218768
128	NC_021977	TGA	2	6	8940	8945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218768
129	NC_021977	CAA	2	6	9340	9345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529218769
130	NC_021977	CTG	2	6	9348	9353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218769
131	NC_021977	ACATAC	2	12	9356	9367	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	529218769
132	NC_021977	CAA	2	6	9472	9477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529218769
133	NC_021977	CAT	2	6	9504	9509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218769
134	NC_021977	TGGA	2	8	9555	9562	25 %	25 %	50 %	0 %	529218769
135	NC_021977	GATT	2	8	9579	9586	25 %	50 %	25 %	0 %	529218769
136	NC_021977	AAT	2	6	9601	9606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529218769
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.